IDT NGS二代測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建接頭
——UDI-UMI全長(zhǎng)接頭、通用短Y型接頭、接頭引物
北京澤平代理的美國(guó)進(jìn)口IDT NGS二代測(cè)序DNA文庫(kù)構(gòu)建接頭Adapter，提供即用型測(cè)序P5/P7全長(zhǎng)接頭（UDI-UMI接頭）、通用短接頭（短Y型接頭）、測(cè)序接頭引物（Index引物），以及定制合成長(zhǎng)、短接頭和接頭引物服務(wù)，用于靈活滿(mǎn)足Illumina二代測(cè)序基因文庫(kù)建庫(kù)需求。
| 應(yīng)用 |
建議接頭 |
特點(diǎn) |
| 無(wú)PCR全基因組測(cè)序（WGS） |
IDT xGen UDl-UMI全長(zhǎng)接頭 |
無(wú)PCR的應(yīng)用領(lǐng)域需要全長(zhǎng)接頭 |
| 無(wú)PCR宏基因組學(xué) |
| 無(wú)PCR測(cè)序（初始量≥100ng） |
| 低水平突變檢測(cè)（低至約1%的頻率） |
靈敏度更高，使用UMI一致性分析去除測(cè)序錯(cuò)誤 |
| 以全長(zhǎng)、雙鏈、初始cDNA開(kāi)始RNA測(cè)序 |
更量化，去除PCR重復(fù) |
| 甲基化測(cè)序 |
IDT xGen UDI-UMI 全長(zhǎng)甲基化接頭，xGen短接頭加UDI引物對(duì)（甲基化接頭） |
亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化需要甲基化胞嘧啶 |
| 全基因組測(cè)序（WGS） |
IDT xGen短接頭加UDI引物對(duì) |
流程簡(jiǎn)單，使用通用接頭制備連接預(yù)混合液，并通過(guò)PCR引入樣本標(biāo)簽 |
| 宏基因組（初始量為1-250ng） |
| 外顯子測(cè)序 |
| 生殖細(xì)胞系靶系列測(cè)序（SNP、插入缺失） |
一、IDT xGen UDI-UMI全長(zhǎng)接頭
即用型IDT xGen UDI-UMI全長(zhǎng)接頭（完整Y型接頭），DNA添加接頭后無(wú)需進(jìn)行PCR，可直接使用Illumina測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。IDT UDI-UMI全長(zhǎng)接頭序列由與Illumina Flowcell表面oligo互補(bǔ)的P5和P7序列、用于區(qū)分不同文庫(kù)的序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index，UDI，即Barcode，含i5/i7 Index）、測(cè)序引物結(jié)合位點(diǎn)（Read 1 SP 和 Read 2 SP，即Rd1 SP 和Rd2 SP）、用于區(qū)分每一個(gè)DNA分子的唯一分子標(biāo)簽（Unique Molecular Identifier, UMI）組成。
IDT UDI-UMI接頭整合了UDI接頭和UMI接頭優(yōu)勢(shì)，大大降低二代測(cè)序中的錯(cuò)配風(fēng)險(xiǎn)，更適合于靈敏檢測(cè)需求。
IDT UDI序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index）在DNA片段兩端各添加唯一Index，通過(guò)交叉驗(yàn)證Index，以區(qū)分不同文庫(kù)，減少I(mǎi)llumina二代測(cè)序時(shí)的標(biāo)簽串?dāng)_和交叉污染問(wèn)題，提高準(zhǔn)確性。IDT Index標(biāo)簽序列由8或10個(gè)堿基組成，提供1536種Index，兼容2色和4色I(xiàn)llumina測(cè)序儀。
IDT UMI唯一分子標(biāo)簽（Unique Molecular Identifier）是短序列，在UDI基礎(chǔ)上，為文庫(kù)中的每個(gè)DNA片段上加入一個(gè)唯一的標(biāo)記，使PCR擴(kuò)增的序列具有相同的插入片段和UMI分子標(biāo)簽，用于識(shí)別原始樣本中的等位基因突變是真實(shí)的低頻突變還是文庫(kù)PCR擴(kuò)增或測(cè)序?qū)е碌腻e(cuò)誤，提高突變檢測(cè)靈敏度。
二、IDT xGen 短接頭和接頭引物
即用型IDT xGen 通用短接頭，為雙鏈體接頭（通用Y型接頭，短Y接頭），直接連接DNA片段后，需使用測(cè)序接頭引物（Index引物），如UDI雙端標(biāo)簽引物、或CDI組合型雙標(biāo)簽引物，通過(guò)PCR將Index序列、P5/P7序列添加到短接頭上。
三、IDT接頭和接頭引物定制合成服務(wù)
IDT提供定制合成服務(wù)，包括可兼容Illumina TruSeq平臺(tái)、Nextera平臺(tái)的各類(lèi)全長(zhǎng)接頭、短Y接頭、Index接頭引物，支持定制單標(biāo)簽（Single Index）、序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index, UDI）、組合型雙標(biāo)簽（Combinatorial Dual Index, CDI）、含UMI的雙端標(biāo)簽（UDI-UMI）的接頭或接頭引物。
同時(shí)，IDT提供定制合成甲基化接頭服務(wù)，包括UDI-UMI全長(zhǎng)甲基化接頭、短甲基化接頭和UDI引物對(duì)等，用于亞硫酸鹽測(cè)序（甲基化測(cè)序）。
北京澤平代理的IDT二代測(cè)序文庫(kù)接頭和引物
| 貨號(hào) |
引物對(duì)數(shù)量 |
產(chǎn)品 |
特點(diǎn) |
| 10006914 |
反應(yīng)數(shù) 16 |
IDT xGen UDI-UMI全長(zhǎng)接頭 |
|
| 10005903 |
反應(yīng)數(shù) 96 |
| 10005976 |
16 |
IDT xGen 通用短接頭和UDI引物 |
8nt |
| 10005921 |
96 |
8nt |
| 10005974 |
|
IDT xGen 通用短接頭 |
|
| 10005924 |
| 10005975 |
16 |
IDT xGen UDI引物 |
8nt |
| 10005922 |
96 |
8nt 1號(hào)96孔板 |
| 10009816 |
96 |
8nt 2號(hào)96孔板 |
| 10008052 |
384 |
10nt 1-4號(hào)96孔板 |
| 10008053 |
768 |
10nt 1-8號(hào)96孔板 |
| 10008054 |
1536 |
10nt 1-16號(hào)96孔板 |
| 10008055 |
384 |
10nt 1-4號(hào)96孔板，2 nmol |
| 10008056 |
768 |
10nt 1-8號(hào)96孔板，2 nmol |
| 10008057 |
1536 |
10nt 1~16號(hào)96孔板，2 nmol |
| 10009815 |
96 |
IDT xGen CDI引物 |
8nt |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺(tái)的全長(zhǎng)接頭 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)、序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)或含UMI分子標(biāo)簽的雙端標(biāo)簽(UDI-UMI)。 |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺(tái)的短接頭及標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺(tái)的標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
兼容Nextera平臺(tái)的標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
甲基化接頭和接頭引物 |
甲基化全長(zhǎng)接頭、甲基化短接頭和接頭引物 |
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