IDT NGS二代測(cè)序全外顯子組基因檢測(cè)雜交捕獲探針組
——全外顯子組測(cè)序WES
北京澤平代理的美國(guó)進(jìn)口IDT NGS二代測(cè)序即用型預(yù)制全外顯子組雜交捕獲探針組(IDT xGen EXOME Hyb Panel v2),用于生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室基礎(chǔ)研究,通過(guò)捕獲探針靶向富集人外顯子序列,進(jìn)行全外顯子組測(cè)序(WES),提供高測(cè)序深度和覆蓋均一性,其性能穩(wěn)定一致,支持探針定制,節(jié)省實(shí)驗(yàn)時(shí)間和成本。
IDT xGex全外顯子雜交捕獲探針組(IDT xGen Exome Hyb Panel v2)為獲得更高的測(cè)序深度并實(shí)現(xiàn)樣品的高度多重檢測(cè),僅靶向RefSeq 109 數(shù)據(jù)庫(kù)中人類編碼基因的編碼序列(CDS),覆蓋34Mb的人類基因組的19,435個(gè)基因,并覆蓋62.9%的融合基因。
IDT全外顯子測(cè)序探針組由415,115條單獨(dú)合成的5'生物素化寡核苷酸探針組成,符合ISO13485生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)。IDT采用大規(guī)模合成工藝,每條捕獲探針單獨(dú)合成,并經(jīng)過(guò)電噴霧電離-質(zhì)譜(ESI-MS)和光密度(OD)單獨(dú)質(zhì)檢,所有探針再以等摩爾濃度組合為高保真探針組。相比傳統(tǒng)微陣列合成法在測(cè)序前無(wú)法識(shí)別缺失或截?cái)嗟奶结槪琁DT單獨(dú)合成法能提供更高質(zhì)量、更具挑戰(zhàn)性的測(cè)序探針,實(shí)現(xiàn)更高的靶向率,即使在高GC含量區(qū)域,也可獲得很高的RefSeq基因的端到端覆蓋率,實(shí)現(xiàn)RefSeq參考數(shù)據(jù)庫(kù)99.5%的覆蓋。
得益于IDT一次性大規(guī)模的探針合成、等量分裝工藝流程,其全外顯子組測(cè)序探針組批次間差異小,能夠讓不同研究者在不同時(shí)間、不同地點(diǎn)用不同分裝管,獲得一致的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,減少二代測(cè)序和下游重復(fù)驗(yàn)證步驟,節(jié)省時(shí)間和資金成本。
IDT xGex全外顯子雜交捕獲探針組,采用新型靶標(biāo)感知算法設(shè)計(jì),并通過(guò)專有的脫靶分析評(píng)估每條探針,可減少脫靶,實(shí)現(xiàn)更全面、更均勻的人類外顯子組覆蓋率。
IDT全外顯子捕獲探針組對(duì)相同數(shù)量的讀段提供深度覆蓋,超過(guò)20×、30×、40×測(cè)序深度的比率很高,實(shí)現(xiàn)高效測(cè)序并節(jié)省成本。
IDT全外顯子組測(cè)序探針組幾乎可以用全外顯子組測(cè)序(WES)的成本得到全基因組測(cè)序(WGS)的效果,其高覆蓋率與WGS數(shù)據(jù)相當(dāng)接近,在不同GC含量區(qū)域引起的捕獲偏差較小。
IDT提供符合ISO13485標(biāo)準(zhǔn)的單條探針定制服務(wù),滿足不斷出現(xiàn)的新基因研究需求,以補(bǔ)充現(xiàn)有IDT xGen Exome Hyb Panel v2,實(shí)現(xiàn)靶基因捕獲的靈活擴(kuò)展。
北京澤平代理的IDT全外顯子雜交捕獲探針組產(chǎn)品
英文名稱 |
中文名稱 |
貨號(hào) |
反應(yīng)數(shù) |
特點(diǎn) |
IDT xGen EXOME Hyb Panel v2 |
IDT xGen研究用全外顯子探針組v2 |
10005151 |
4 |
使用針對(duì)19,433個(gè)基因的外顯子雜交捕獲探針組,產(chǎn)品依據(jù)GMP標(biāo)準(zhǔn)制造。 |
10005152 |
16 |
10005153 |
96 |
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——IDT一級(jí)代理商,北京澤平